Indonesia adalah salah satu negara pusat keanekaragaman hayati di dunia. Keanekaragaman hayati Indonesia menempati rangking kedua di dunia setelah Brazil. Proses klasifikasi makhluk hidup atau taksonomi dimulai dengan mengelompokkan beberapa individu yang memiliki persamaan ciri ke dalam satu kelompok. Kelompok-kelompok yang terbentuk dari hasil pengklasifikasian makhluk hidup tersebut disebut takson. Takson pada tingkat yang lebih rendah memiliki persamaan sifat dan ciri yang lebih banyak, sedangkan takson pada tingkat yang lebih tinggi memiliki persamaan sifat dan ciri yang lebih sedikit.
Secara umum, tujuan dari penyusunan klasifikasi suatu kelompok organisme adalah untuk menunjukkan hubungan berbagai taksa dalam suatu sistem hirarkis. Karena jenjang dan ruang lingkup takson yang beragam, maka masing-masing takson perlu diberi nama untuk membedakannya dari takson yang lain, dan dari kata takson inilah kemudian berkembang istilah taksonomi dalam sistem ekologi. Setiap system ekologi akan mencatat jenis-jenis organisme yang ada pada ekosistem tersebut berdasarkan taksonominya. Sehingga untuk membangun sistem informasi ekologi harus disiapkan sistem informasi classifikasi mahluk hidup atau taxonomy sebagai informasi utama untuk membantu sistem informasi ekologi.